если она не подпадает под защищенные категории типа матери-одиночки и т.д., то тогда ее увольнение проходит по стандартным процедурам. Ведь отпуск-то заканчивается и она становится обыкновенным сотрудником компании, к которому применяются ПВТР, ДИ и все процедуры по изменению условий труда, как вариант дальнейших действий.
Но лучше конечно по-хорошему пытаться договориться

всем спокойнее будет.