Вот теперь вполне уместным будет письмо (адрес у Вас уже есть - из её письма),
в котором следует изложить все нюансы её неправоты:
- заявление написано не по форме,
- подано не туда,
- совершены прогулы (с момента подачи заявления до принятия решения по нему) и т.д. и т.п.,
предложить варианты решения вопроса (увольнение по п. 1 ст. 36, по п. 4 ст. 40, по ст. 38),
пригласить для обсуждения этих вариантов, оформления увольнения и получения ТК.
Вот тогда Ваша позиция (даже в суде) будет незыблема
