ой, смешались в кучу кони, люди и штатное расписание с кол.договором. с одной стороны, хозяин - барин, строгой лимитации, что может быть дополнением к КД, нет. однако настоятельно не рекомендую делать штатное расписание дополнением к КД, т.к. в случае изменения штатного расписания - Вам необходимо будет проходит всю процедуру внесения изменений в КД.
относительно требований инспекции. они не так уж и безосновательны. инспекция может проверять кол.договор на предмет соответствия нормативным актам. все положения КД, которые не соответствуют законодательству будут недействительны и инспекция может попросить привести КД в соответствие с законодательными нормами. подписывать ли при этом новый КД - Вам решать

...вот такая вот подковырка. так что, если они правильно сформулируют - тогда свои полномочия не превысят. это тот случай. когда зависит, как яхту назовут...а про отраслевое соглашение: Вы его почитайте. посмотрите распространяется ли оно на ваше предприятие. это и будет ответ инспекции - надо его брать за базу в КД или нет.