Насколько я Вас понял – то у Вас не ликвидируется предприятие А, а происходит реогранизация предприятий А и Б путем слияния. Соответственно получившаяся в результате слияния компания В (или Б «поглотившая» компанию А) становится правопреемником обеих компаний.
Согласно требованиям ст. 36 КЗоТа Украины, трудовой договор с сотрудником в такой ситуации продолжается (т.е. увольнять никого, в т.ч. и беременную сотрудницу) не надо.
В итоге компания-правопреемник берет на себя все обязательства по выполнению законодательства и по отношению к беременной сотруднице.
Надеюсь, что правильно понял суть Вашего вопроса и натолкнул на правильное направление мыслей