Я бы подождал до 17.09, получил бы ЛН на руки, оформил бы его, как положено, и передал в бухгалтерию вместе со скорректированным табелем и приказом, в котором приказал бы бухгалтерии "
в связи с болезнью ххх произвести перерасчёт ЗП за сентябрь", а к компенсации добавил бы этот самый один день...

Само собой, туда же и тогда же отдал бы приказ об увольнении !!!

(с компенсацией "неотгулянных" дней отпуска, есссно !)