Читаем ст.32 КЗоТ:
Отсюда следует, что если центры "Николаев" и "Киев" находятся в разных местностях, то это является переводом на другую работу и допускается только по согласию работника (за исключением обстоятельств, перечисленных в ст.33 КЗоТ).

Соглашение есть и приказ уже подписан директором, меня больше интересует, вносить в ТК или нет, так как перемещения не вносятся, а переводы вносятся, вот уже и запуталась.

Что написано в приказе? Дословно?

ПЕРЕВЕСТИ, но у нас пишут и на перемещение ПЕРЕВЕСТИ.

Перевести - а дальше?) Можете текст приказа процитировать?

Если оба центра в Вашем ШР представлены как отдельные самостоятельные подразделения - то это перевод и вносится в ТК

ПЕРЕВЕСТИ з 23.06.2018
Іванова Івана Івановича, з посади інженера центру "Миколаїв" на посаду інженера центру "Київ".
Підстава: заява Іванова І.І.

У этих центров разные начальники но один директор.

Вот так и пишите в ТК:

Директора и одного достаточно)))
По тексту приказа видно, что перевод:thumbs up:. Пишите в ТК

Но Вам же, уже, выше, ответили:
:reverie:

Добрый день, прошу совета старших коллег.
Есть сотрудник который числится в одном подразделение (г. Херсон), а его переместили в другое подразделение (г. Пологи) территориально проживает он в г. Пологи. Это будет перемещение или перевод?
Фукции его не меняются, зона которую он обслуживал остается та же, только меняется с центра "Херсон" на центр "Пологи".