Поскольку предприятие само определяет формы и системы оплаты труда, вам всем нужно собраться и договориться о единицах учета, порядке округления и т.д. А ответственность за организацию учета и оплаты лежит на руководителе .
В конце-концов Ваша "система" - это же не иноплатнетный разум? Как программисты запрограммируют - так она и будет считать, в часах, минутах, числах, и даже в световых годах.
Думаю можно вполне табель формировать в часах с желаемой точностью, но сумма за каждый день должна равняться графе "итого за месяц".