Вообще-то заявление об увольнении подаётся руководителю предприятия (на его имя) или его заместителю, на которого возложены обязанности по приёму и увольнению сотрудников.
Отсюда следует, что подавать заявление следует в канцелярию (секретарю).
Вот тут-то и происходит его регистрация в
книге регистрации входящей корреспонденции.
На копии заявления (если это необходимо) зав. канцелярией (секретарь) ставит входящий номер и дату приёма заявления.
Вот так делают в приличных организациях