В одной из компаний этот вопрос был решен через возложение обязанностей по ведению кадрового учета на одну сотрудницу с доплатой. Сотрудница была то ли бухгалтером, то ли секретарем, точно не помню. Она приезжала в Киев на обучение, один раз я съездила в филиал. Она замечательно со всем справлялась, и никаких проблем не было. Хотя трудовые все же хранились в Киеве.
В другой компании этими вопросами занимались руководители филиалов, и это был кошмар. Им, конечно, не было до этого дела. Однажды даже потеряли трудовую сотрудника.
Поэтому мне кажется, лучше брать человека, который будет работать в филиале.