Я тоже считаю, что нужно шифровать дни как положено - раз командировка, то приказ/распоряжение и оплата по среднему. Иначе получается, что бухи спят спокойно (и средний не "колупаться" не считать, и табель Ваш без командировок - как с гуся вода бухи получаются), а вы переживаете, спрашиваете. Чем Вы хуже их?
Пусть работают как положено, а не "не хотят".