Запись о совместительстве впишете после увольнения сотрудника из компании. Закрыли запись по основному месту, следом сделали вторую - с приемом по совместительству и увольнением. Ведь могут быть еще какие-то промежуточные записи, переводы... Не спешите тулить туда совместительство и перепутать все записи.
Как потом увольнять?
Ну вот, не успели принять... Посмотрите по ситуации. Она может уволиться с совместительства и остаться работать по основному. Либо уволиться с основного, потом с совместительства и приняться зав. складом по основному. Это всё разные ситуации.