Если платите - указываете в приказе "покласти на Петрову А,П, головного бухгалтера, за її згодою, виконання обов’язків директора на період його перебування у щорічній відпустці з ....по .... з доплатою ....% від посадового окладу директора"
А если ничего не платите - то, соответственно, ничего и не указываете.
А почему не платите - это вы уже в объяснительной писать будете при проверке
