Смотрите по смыслу - по проф. группам и по квалификационным характеристикам.
1) Для начальника сектора есть два кода - 1221.2 и 1229.7
1221.2 - Головні фахівці - керівники та технічні керівники виробничих підрозділів у промисловості
1229.7 - Керівники інших основних підрозділів в інших сферах діяльності
При этом код 1229.7 ссылается на ДКХП 66 - Залізничний транспорт і метрополітен и 5 - Видобувна промисловість. Как говорится, выбирайте, что Вам больше подходит
2) Завідувач канцелярії код КП 1229.1 и 1231
1229.1 - Керівні працівники апарату центральних органів державної влади
1231 - Керівники фінансових, бухгалтерських, економічних, юридичних та адміністративних підрозділів та інші керівники
Тут, по-моему, все понятно