Андрію, у наказі № 246 йдеться про попередній та періодичний огляд працівників, зайнятих на важких роботах, роботах із шкідливими чи небезпечними умовами праці або таких, де є потреба у професійному доборі, щорічному обов'язковому медичному огляді осіб віком до 21 року. А у запитанні йдеться про переогляд МСЕК. Тому швидше тут керуватися треба
http://zakon3.rada.gov.ua/laws/show/1317-2009-%D0%BF. Насамперед слід з"ясувати:
1) який документ є у працівника за час відсутності (імовірно, це буде довідка, а не листок непрацездатності, оскільки це не первинне встановлення інвалідності після тимч.непрацездатності);
2) чи оплачується відсутність працівника.
А тоді вже буде зрозуміло, чи продовжувати/переносити щорічну відпустку, чи ні. Швидше за все - ні.