Я в таких случаях создаю приказ по основной деятельности не только о том, что меняется название тех или иных подразделений по тем или иным причинам (тут и штатное меняется и сама административно-организационная структура), а и второй приказ о личном составе о том, что по тем-то причинам сотрудников такого-то подразделения переводят в такое-то подразделение...