У нас предприятии уволился глава профкома (по собств. желанию). Действующий кол.договор до 2015 года. Какие наши действия? Установить временно исполняющего обязанности главы профкома? На основании собрания членов комиссии или всего коллектива? Надо ли перезаключать по причине увольнения новый кол.договор досрочно? Или какой алгоритм в данной ситуации?

Если быть более точным - председатель профсоюзного комитета

Председатель профкома - должность выборная, поэтому его увольнение по собственному желанию осуществляется профсоюзным комитетом: он пишет заявление, профком дает согласие на его увольнение и выбирает нового председателя. А на колдоговор увольнение или переизбрание председателя профком никак не влияет.
Алгоритм ваших действий прост: после получения согласия профкома на увольнение старого председателя и выборы нового увольняете старого и принимаете нового на основании его заявления и протокола решения профкома о его избрании :)